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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
31/03/1993 |
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Data da última atualização: |
05/03/2024 |
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Autoria: |
RESENDE, R. de O.; HAAN, P. de; VOSSEN, E. van de; AVILA, A. C. de; GOLDBACH, R.; PETERS, D. |
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Afiliação: |
RENATO DE OLIVEIRA RESENDE; PETER DE HAAN; EDWIN VAN DE VOSSEN; ANTONIO CARLOS DE AVILA, CNPH; ROB GOLDBACH; DICK PETERS. |
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Título: |
Defective interfering L RNA segments of tomato spotted wilt virus retain both virus genome termini and have extensive internal deletions. |
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Ano de publicação: |
1992 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of General Virology, v. 73, p. 2509-2516, 1992. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1099/0022-1317-73-10-2509 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Defective interfering (DI) RNA molecules derived from the genomic L RNA segment of tomato spotted wilt virus (TSWV) were generated during sequential passage of the virus at high multiplicity. Characterization of DI RNAs from four distinct isolates by Northern blot analysis and sequence determination revealed that both the 5′ and 3′ genomic termini were retained in these molecules. Each DI RNA contained a single internal deletion of approximately 60% to 80% of the L RNA segment. All DI RNAs studied maintain an open reading frame (ORF) which suggests that these defective molecules should be translatable by ribosomes. Detection of only defective molecules with ORFs indicates either that association with ribosomes or translation is a prerequisite for the selection and maintenance of replicating DI RNAs, or that the truncated proteins produced play a role in their selection or replication. Analysis of the junction sites in the DI RNAs showed that short nucleotide sequences are repeated, one at the release and another at the reinitiation point on the L RNA. One of these is lost during the generation of the DI molecules. The presence of repeated sequences at the junction sites seems to be unique for tospovirus DI L RNAs; they have not been described for other DI systems of either positive- or negative-strand RNA viruses. A model for TSWV DI RNA generation is proposed in which the viral polymerase can ‘jump’ across the internal sequences from one secondary structure to another containing the repeated sequences, during the replication of the viral complementary L RNA segment. MenosDefective interfering (DI) RNA molecules derived from the genomic L RNA segment of tomato spotted wilt virus (TSWV) were generated during sequential passage of the virus at high multiplicity. Characterization of DI RNAs from four distinct isolates by Northern blot analysis and sequence determination revealed that both the 5′ and 3′ genomic termini were retained in these molecules. Each DI RNA contained a single internal deletion of approximately 60% to 80% of the L RNA segment. All DI RNAs studied maintain an open reading frame (ORF) which suggests that these defective molecules should be translatable by ribosomes. Detection of only defective molecules with ORFs indicates either that association with ribosomes or translation is a prerequisite for the selection and maintenance of replicating DI RNAs, or that the truncated proteins produced play a role in their selection or replication. Analysis of the junction sites in the DI RNAs showed that short nucleotide sequences are repeated, one at the release and another at the reinitiation point on the L RNA. One of these is lost during the generation of the DI molecules. The presence of repeated sequences at the junction sites seems to be unique for tospovirus DI L RNAs; they have not been described for other DI systems of either positive- or negative-strand RNA viruses. A model for TSWV DI RNA generation is proposed in which the viral polymerase can ‘jump’ across the internal sequences from one secondary structure to another conta... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caracterizacao; Characterization; DI L RNA; Generation; Geracao; Maintenance; TSWV; Vira-Cabeca. |
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Thesagro: |
Manutenção. |
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Thesaurus Nal: |
Tomato spotted wilt virus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02548naa a2200313 a 4500
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005 2024-03-05
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520 $aDefective interfering (DI) RNA molecules derived from the genomic L RNA segment of tomato spotted wilt virus (TSWV) were generated during sequential passage of the virus at high multiplicity. Characterization of DI RNAs from four distinct isolates by Northern blot analysis and sequence determination revealed that both the 5′ and 3′ genomic termini were retained in these molecules. Each DI RNA contained a single internal deletion of approximately 60% to 80% of the L RNA segment. All DI RNAs studied maintain an open reading frame (ORF) which suggests that these defective molecules should be translatable by ribosomes. Detection of only defective molecules with ORFs indicates either that association with ribosomes or translation is a prerequisite for the selection and maintenance of replicating DI RNAs, or that the truncated proteins produced play a role in their selection or replication. Analysis of the junction sites in the DI RNAs showed that short nucleotide sequences are repeated, one at the release and another at the reinitiation point on the L RNA. One of these is lost during the generation of the DI molecules. The presence of repeated sequences at the junction sites seems to be unique for tospovirus DI L RNAs; they have not been described for other DI systems of either positive- or negative-strand RNA viruses. A model for TSWV DI RNA generation is proposed in which the viral polymerase can ‘jump’ across the internal sequences from one secondary structure to another containing the repeated sequences, during the replication of the viral complementary L RNA segment.
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
13/12/2005 |
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Data da última atualização: |
13/12/2005 |
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Autoria: |
OLIVEIRA, M. D. de; CALHEIROS, D. F. |
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Afiliação: |
Embrapa Pantanal (Corumbá, MS). |
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Título: |
Características e alterações limnológicas na Bacia do Rio Taquari. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: GALDINO, S.; VIEIRA, L. M.; PELLEGRIN, L. A. (Ed.). Impactos ambientais e socioeconômicos nas Bacia do rio Taquari - Pantanal. Corumbá: Embrapa Pantanal, 2005. |
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Páginas: |
p.199-208. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os impactos causados por processos de erosão e o assoreamento resultante são questões importantes a serem consideradas em programas de pesquisa na área de Limnologia, tendo em vista sua importância na alteração da qualidade da água e no funcionamento dos sistemas aquáticos. O aumento da concentração de sedimentos, além de causar assoreamento dos rios, altera as características físicas e químicas da água, modificando principalmente a qualidade óptica e a temperatura da água (Alabaster & Lloyd 1982). Os sólidos suspensos depositam-se sobre plantas aquática e, em altas concentrações, podem impedir o cescimento de comunidades microscópicas que vivem aderidas aos pecíolos, folhas, caules e raízes das macrófitas (perifíton), formadadas por algas bactérias e protozoários (Oliveira & Rodrigues, 2002). Os sólidos suspensos podem aderir à superfície dos ovos de peixes, impedindo as rocas de oxigênio e dióxido de carbono, comprometendo a eclosão e desenvolvimento dos mesmos. Aleim disso, podem aderir às brânquias e prejudicar as funções de respiração e excreção. O processo de sedimentação acentuada promove a cobertura do fundo e a mobilidade do leito, afetando os organismos que vivem nesse compartimento dos rios, os organismos bentônicos (Alabaster & Lloyd, 1982; Wantzen, 1995, 1998 e 1999). Neste capítulo analisamos a entrada de nutrientes e sólidos suspensos na Bacia do Rio Taquari e seus efeitos sobre a qualidade da água e biomassa algal. |
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Palavras-Chave: |
Alteração limnológica; Bacia do Rio Taquari; Característica. |
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Thesagro: |
Água; Qualidade. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02185naa a2200205 a 4500
001 1811860
005 2005-12-13
008 2005 bl uuuu u00u1 u #d
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245 $aCaracterísticas e alterações limnológicas na Bacia do Rio Taquari.
260 $c2005
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520 $aOs impactos causados por processos de erosão e o assoreamento resultante são questões importantes a serem consideradas em programas de pesquisa na área de Limnologia, tendo em vista sua importância na alteração da qualidade da água e no funcionamento dos sistemas aquáticos. O aumento da concentração de sedimentos, além de causar assoreamento dos rios, altera as características físicas e químicas da água, modificando principalmente a qualidade óptica e a temperatura da água (Alabaster & Lloyd 1982). Os sólidos suspensos depositam-se sobre plantas aquática e, em altas concentrações, podem impedir o cescimento de comunidades microscópicas que vivem aderidas aos pecíolos, folhas, caules e raízes das macrófitas (perifíton), formadadas por algas bactérias e protozoários (Oliveira & Rodrigues, 2002). Os sólidos suspensos podem aderir à superfície dos ovos de peixes, impedindo as rocas de oxigênio e dióxido de carbono, comprometendo a eclosão e desenvolvimento dos mesmos. Aleim disso, podem aderir às brânquias e prejudicar as funções de respiração e excreção. O processo de sedimentação acentuada promove a cobertura do fundo e a mobilidade do leito, afetando os organismos que vivem nesse compartimento dos rios, os organismos bentônicos (Alabaster & Lloyd, 1982; Wantzen, 1995, 1998 e 1999). Neste capítulo analisamos a entrada de nutrientes e sólidos suspensos na Bacia do Rio Taquari e seus efeitos sobre a qualidade da água e biomassa algal.
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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